Seorang Protestan dan pemimpin Reformasi Skotlandia, John Knox (David Tennant), memandang Mary sebagai ancaman bagi supremasi Protestan kerajaan.
Pada hari pertamanya, Mary terpaksa mengusir John dari istana karena ia menolak menunjukkan sikap toleransi.
Di Inggris, sepupu Mary, Elizabeth (Margot Robbie), dikenal sebagai ratu yang tak mau menikah ataupun memiliki keturunan.
Kembalinya Mary menjadi Ratu Skotlandia membuat Elizabeth gelisah karena tahtanya terancam.
Elizabeth berencana melemahkan kedudukan sepupunya dengan cara menikahkannya dengan pria Inggris.
Ia kemudian meyakinkan Robert Dudley (Joe Alwyn), yang diam-diam ia cintai, supaya mau menikahi Mary.
Awalnya Mary menolak, namun berita mengenai cacar yang menyerang Elizabeth membuatnya berubah pikiran.
Baca Juga: Siapa Hannah Owo Twitter Viral? Link Video Banyak Dicari Warganet yang Penasaran